Project B2
Proteolysis in the regulation of caspase-independent programmed cell death
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Summary of the project
By analysis of death receptor-mediated caspase-independent programmed cell death (ciPCD) through immunomagnetic sorting and proteomic approaches, we (i) aim to detect signaling components involved in the proteolytic regulation of ciPCD, (ii) identify the yet unknown serine protease(s) that appear to be crucial in this pathway, and (iii) isolate as well as (iv) characterize their substrates. In a complementary approach, we will (v) perform a small interfering siRNA screen of all 566 proteases encoded by the human genome to define their relevance in ciPCD. As a secondary goal, we want to (vi) clarify how acid sphingomyelinase undergoes proteolytic maturation/activation during ciPCD.
Durch Analyse des Todesrezeptor-vermittelten Caspase-unabhängigen programmierten Zelltodes (ciPCD) mittels immunomagnetischer Sortierung und Protein-analytischen Ansätzen streben wir an, (i) an der proteolytischen Regulation des ciPCD beteiligte Signalkomponenten ausfindig zu machen, (ii) bislang unbekannte Serinproteasen zu identifizieren, die in diesem Signalweg wichtig sind, sowie ihre Substrate (iii) zu ermitteln und (iv) zu charakterisieren. In einem komplementären Ansatz werden wir (v) alle 566 im humanen Genom kodierten Proteasen mittels eines „small interfering“ siRNA screens auf ihre Relevanz im ciPCD untersuchen. Als sekundäres Ziel wollen wir (vi) aufklären, wie die proteolytische Reifung/Aktivierung der sauren Sphingomyelinase im ciPCD erfolgt.
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